Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PolbQ8K409 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PolbQ8K409 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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