Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stn1Q8K2X3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms