Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms