Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Mtmr3Q8K296 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Mtmr3Q8K296 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mtmr3Q8K296 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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