Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Fcho1Q8K285 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Fcho1Q8K285 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Fcho1Q8K285 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Fcho1Q8K285 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Fcho1Q8K285 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Fcho1Q8K285 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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