Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a8Q8JZR6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms