Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trip10Q8CJ53 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip10Q8CJ53 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms