Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG7

Rapgef2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef2Q8CHG7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef2Q8CHG7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef2Q8CHG7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms