Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upp2Q8CGR7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms