Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Slc43a2Q8CGA3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Slc43a2Q8CGA3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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