Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gpc3Q8CFZ4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc3Q8CFZ4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gpc3Q8CFZ4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gpc3Q8CFZ4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gpc3Q8CFZ4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc3Q8CFZ4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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