Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClasrpQ8CFC7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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