Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Snx30Q8CE50 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx30Q8CE50 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx30Q8CE50 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx30Q8CE50 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx30Q8CE50 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx30Q8CE50 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx30Q8CE50 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx30Q8CE50 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx30Q8CE50 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx30Q8CE50 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx30Q8CE50 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx30Q8CE50 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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