Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc17Q8CE13 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc17Q8CE13 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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