Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam228aQ8CDW1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam228aQ8CDW1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms