Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc178Q8CDV0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms