Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc38Q8CDN8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc38Q8CDN8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms