Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Nhlrc3Q8CCH2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Nhlrc3Q8CCH2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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