Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ephb1Q8CBF3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ephb1Q8CBF3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms