Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrip1Q8CBD1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrip1Q8CBD1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms