Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc159Q8C963 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms