Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppfibp1Q8C8U0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms