Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms