Protein–RNA interactions for Protein: Q8C176

Taf2, Transcription initiation factor TFIID subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf2Q8C176 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf2Q8C176 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf2Q8C176 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf2Q8C176 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf2Q8C176 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf2Q8C176 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf2Q8C176 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf2Q8C176 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf2Q8C176 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf2Q8C176 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf2Q8C176 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf2Q8C176 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf2Q8C176 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms