Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYY4

Ttc39b, Tetratricopeptide repeat protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39bQ8BYY4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc39bQ8BYY4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39bQ8BYY4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms