Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx17Q8BVL3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms