Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp43Q8BUM9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp43Q8BUM9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp43Q8BUM9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp43Q8BUM9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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