Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sfr1Q8BP27 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sfr1Q8BP27 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sfr1Q8BP27 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sfr1Q8BP27 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sfr1Q8BP27 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sfr1Q8BP27 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sfr1Q8BP27 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sfr1Q8BP27 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sfr1Q8BP27 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sfr1Q8BP27 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sfr1Q8BP27 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfr1Q8BP27 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms