Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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