Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc2Q8BKV1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms