Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop53Q8BK35 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms