Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rufy1Q8BIJ7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms