Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4bQ8BGE6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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