Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htatsf1Q8BGC0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Htatsf1Q8BGC0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Htatsf1Q8BGC0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htatsf1Q8BGC0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms