Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChfrQ810L3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms