Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ttc28Q80XJ3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ttc28Q80XJ3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ttc28Q80XJ3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ttc28Q80XJ3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ttc28Q80XJ3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ttc28Q80XJ3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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