Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC3

Usp6nl, USP6 N-terminal-like protein, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp6nlQ80XC3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp6nlQ80XC3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp6nlQ80XC3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms