Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Zbed4Q80WQ9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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Zbed4Q80WQ9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Zbed4Q80WQ9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbed4Q80WQ9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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