Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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