Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms