Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tmc3Q7TQ69 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tmc3Q7TQ69 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc3Q7TQ69 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmc3Q7TQ69 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmc3Q7TQ69 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc3Q7TQ69 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms