Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actn1Q7TPR4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actn1Q7TPR4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms