Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SpopQ6ZWS8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SpopQ6ZWS8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms