Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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