Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tfap2eQ6VUP9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tfap2eQ6VUP9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms