Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc85bQ6PDY0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms