Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cachd1Q6PDJ1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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