Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Herc4Q6PAV2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms