Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Senp6Q6P7W0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Senp6Q6P7W0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms