Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smchd1Q6P5D8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms